MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CCDC5180 chromosome

Total Repeats: 96809

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017522	CAC	2	6	27	32	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385989535
2	NC_017522	GTC	2	6	46	51	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989535
3	NC_017522	GAC	2	6	79	84	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989535
4	NC_017522	CAG	2	6	90	95	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989535
5	NC_017522	TCG	2	6	167	172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989535
6	NC_017522	AGC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989535
7	NC_017522	GCC	2	6	260	265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989535
8	NC_017522	CCG	2	6	304	309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989535
9	NC_017522	CGAC	2	8	311	318	25 %	0 %	25 %	50 %	385989535
10	NC_017522	CGA	2	6	324	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989535
11	NC_017522	GCC	2	6	339	344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989535
12	NC_017522	ACG	2	6	389	394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989535
13	NC_017522	TGA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385989535
14	NC_017522	CGTT	2	8	527	534	0 %	50 %	25 %	25 %	385989535
15	NC_017522	CGC	3	9	561	569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989535
16	NC_017522	CCCG	2	8	589	596	0 %	0 %	25 %	75 %	385989535
17	NC_017522	AC	3	6	643	648	50 %	0 %	0 %	50 %	385989535
18	NC_017522	GGCA	2	8	660	667	25 %	0 %	50 %	25 %	385989535
19	NC_017522	GTT	2	6	681	686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385989535
20	NC_017522	CGA	2	6	810	815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989535
21	NC_017522	TTC	2	6	856	861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385989535
22	NC_017522	CAA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385989535
23	NC_017522	TCATC	2	10	902	911	20 %	40 %	0 %	40 %	385989535
24	NC_017522	CCCA	2	8	918	925	25 %	0 %	0 %	75 %	385989535
25	NC_017522	AGC	2	6	926	931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989535
26	NC_017522	ACC	2	6	993	998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385989535
27	NC_017522	CGA	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989535
28	NC_017522	CAG	2	6	1086	1091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989535
29	NC_017522	GC	3	6	1121	1126	0 %	0 %	50 %	50 %	385989535
30	NC_017522	GCG	2	6	1237	1242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989535
31	NC_017522	CCG	2	6	1259	1264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989535
32	NC_017522	CA	3	6	1408	1413	50 %	0 %	0 %	50 %	385989535
33	NC_017522	CAC	2	6	1491	1496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385989535
34	NC_017522	GGT	2	6	1652	1657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385989536
35	NC_017522	GAG	2	6	1663	1668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385989536
36	NC_017522	CCG	2	6	1673	1678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989536
37	NC_017522	GCGG	2	8	1690	1697	0 %	0 %	75 %	25 %	385989536
38	NC_017522	GAA	2	6	1853	1858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385989536
39	NC_017522	GCTGA	2	10	1862	1871	20 %	20 %	40 %	20 %	385989536
40	NC_017522	GCG	2	6	1879	1884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989536
41	NC_017522	TTC	2	6	1937	1942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385989536
42	NC_017522	GTCGA	2	10	2035	2044	20 %	20 %	40 %	20 %	385989537
43	NC_017522	CA	3	6	2049	2054	50 %	0 %	0 %	50 %	385989537
44	NC_017522	CTA	2	6	2091	2096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385989537
45	NC_017522	GCC	2	6	2120	2125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989537
46	NC_017522	CGC	2	6	2172	2177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989537
47	NC_017522	TGA	2	6	2264	2269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385989537
48	NC_017522	ACC	2	6	2290	2295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385989537
49	NC_017522	CCG	2	6	2345	2350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989537
50	NC_017522	ACC	2	6	2373	2378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385989537
51	NC_017522	CAA	2	6	2554	2559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385989537
52	NC_017522	CCA	2	6	2589	2594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385989537
53	NC_017522	AGCG	2	8	2632	2639	25 %	0 %	50 %	25 %	385989537
54	NC_017522	AGGC	2	8	2648	2655	25 %	0 %	50 %	25 %	385989537
55	NC_017522	GTCG	2	8	2664	2671	0 %	25 %	50 %	25 %	385989537
56	NC_017522	CG	3	6	2790	2795	0 %	0 %	50 %	50 %	385989537
57	NC_017522	CGC	2	6	2818	2823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989537
58	NC_017522	GCG	2	6	2837	2842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989537
59	NC_017522	CCG	2	6	2848	2853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989537
60	NC_017522	CTA	2	6	2871	2876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385989537
61	NC_017522	GCC	2	6	2896	2901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989537
62	NC_017522	CGTTT	2	10	3450	3459	0 %	60 %	20 %	20 %	385989538
63	NC_017522	GTGG	2	8	3490	3497	0 %	25 %	75 %	0 %	385989538
64	NC_017522	GCCA	2	8	3508	3515	25 %	0 %	25 %	50 %	385989538
65	NC_017522	CGGTGC	2	12	3522	3533	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385989538
66	NC_017522	GTT	2	6	3544	3549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385989538
67	NC_017522	CCG	2	6	3600	3605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989538
68	NC_017522	TTG	2	6	3662	3667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385989538
69	NC_017522	CGA	2	6	3765	3770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989538
70	NC_017522	TTG	2	6	3821	3826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385989538
71	NC_017522	ATT	2	6	3835	3840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385989538
72	NC_017522	TCAG	2	8	3852	3859	25 %	25 %	25 %	25 %	385989538
73	NC_017522	CGC	2	6	3868	3873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989538
74	NC_017522	GAC	2	6	3881	3886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989538
75	NC_017522	GGT	2	6	3934	3939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385989538
76	NC_017522	CGT	2	6	3993	3998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989538
77	NC_017522	GCC	2	6	4049	4054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989538
78	NC_017522	CGG	2	6	4066	4071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989538
79	NC_017522	CGTT	2	8	4078	4085	0 %	50 %	25 %	25 %	385989538
80	NC_017522	GCA	2	6	4152	4157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989538
81	NC_017522	CTT	2	6	4166	4171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385989538
82	NC_017522	AC	3	6	4213	4218	50 %	0 %	0 %	50 %	385989538
83	NC_017522	CCA	2	6	4227	4232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385989538
84	NC_017522	GC	3	6	4290	4295	0 %	0 %	50 %	50 %	385989538
85	NC_017522	GAT	2	6	4346	4351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385989538
86	NC_017522	TTG	3	9	4374	4382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385989538
87	NC_017522	ACGG	2	8	4430	4437	25 %	0 %	50 %	25 %	385989538
88	NC_017522	GCCT	2	8	4492	4499	0 %	25 %	25 %	50 %	385989538
89	NC_017522	CGG	2	6	4563	4568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989538
90	NC_017522	CGGTT	2	10	4599	4608	0 %	40 %	40 %	20 %	385989538
91	NC_017522	CGTC	2	8	4643	4650	0 %	25 %	25 %	50 %	385989539
92	NC_017522	TTG	2	6	4720	4725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385989539
93	NC_017522	CGA	2	6	4774	4779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989539
94	NC_017522	GGTA	2	8	4823	4830	25 %	25 %	50 %	0 %	385989539
95	NC_017522	GTG	2	6	4857	4862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385989539
96	NC_017522	ACG	2	6	4864	4869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989539
97	NC_017522	CAA	2	6	4913	4918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385989539
98	NC_017522	ATC	2	6	4934	4939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385989539
99	NC_017522	TGT	2	6	4981	4986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385989539
100	NC_017522	GGTT	2	8	5005	5012	0 %	50 %	50 %	0 %	385989539
101	NC_017522	CGG	2	6	5031	5036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989539
102	NC_017522	GAT	2	6	5046	5051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385989539
103	NC_017522	GT	3	6	5170	5175	0 %	50 %	50 %	0 %	385989539
104	NC_017522	TGG	2	6	5227	5232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385989539
105	NC_017522	CCGC	2	8	5233	5240	0 %	0 %	25 %	75 %	385989539
106	NC_017522	GAA	2	6	5273	5278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385989539
107	NC_017522	AGC	2	6	5387	5392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989539
108	NC_017522	GGC	2	6	5402	5407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989539
109	NC_017522	GGC	2	6	5411	5416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989539
110	NC_017522	GAC	2	6	5469	5474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989539
111	NC_017522	GGC	2	6	5558	5563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989539
112	NC_017522	TGG	2	6	5585	5590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385989539
113	NC_017522	GTT	2	6	5600	5605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385989539
114	NC_017522	CGA	2	6	5609	5614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989539
115	NC_017522	CGG	2	6	5659	5664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989539
116	NC_017522	CCG	2	6	5671	5676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989539
117	NC_017522	CCG	2	6	5716	5721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989539
118	NC_017522	GGT	2	6	5780	5785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385989539
119	NC_017522	TGC	3	9	5890	5898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989540
120	NC_017522	CG	5	10	5900	5909	0 %	0 %	50 %	50 %	385989540
121	NC_017522	GTCGG	2	10	5947	5956	0 %	20 %	60 %	20 %	385989540
122	NC_017522	CGA	2	6	5969	5974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989540
123	NC_017522	GGT	2	6	6103	6108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385989540
124	NC_017522	CCA	2	6	6112	6117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385989540
125	NC_017522	ACG	2	6	6150	6155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989540
126	NC_017522	CGC	2	6	6235	6240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989540
127	NC_017522	CGG	2	6	6285	6290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989540
128	NC_017522	CG	3	6	6336	6341	0 %	0 %	50 %	50 %	385989540
129	NC_017522	AAG	2	6	6613	6618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385989541
130	NC_017522	GGT	2	6	6741	6746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385989541
131	NC_017522	CGA	2	6	6759	6764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989541
132	NC_017522	TGC	2	6	6800	6805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989541
133	NC_017522	CGA	2	6	6831	6836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989541
134	NC_017522	CCAC	2	8	6857	6864	25 %	0 %	0 %	75 %	385989541
135	NC_017522	ACCG	2	8	6876	6883	25 %	0 %	25 %	50 %	385989541
136	NC_017522	GTG	2	6	6889	6894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385989541
137	NC_017522	CGG	2	6	6912	6917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989541
138	NC_017522	TGG	2	6	6948	6953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385989541
139	NC_017522	CGGCGT	2	12	6960	6971	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385989541
140	NC_017522	GGT	2	6	6975	6980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385989541
141	NC_017522	CAAG	2	8	7071	7078	50 %	0 %	25 %	25 %	385989541
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143	NC_017522	CGCC	2	8	7167	7174	0 %	0 %	25 %	75 %	385989541
144	NC_017522	CAA	2	6	7197	7202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385989541
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150	NC_017522	GC	3	6	7562	7567	0 %	0 %	50 %	50 %	385989541
151	NC_017522	GGT	2	6	7575	7580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385989541
152	NC_017522	AAGGAC	2	12	7612	7623	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385989541
153	NC_017522	AGACCA	2	12	7706	7717	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385989541
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156	NC_017522	ATC	2	6	8050	8055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385989541
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158	NC_017522	ATC	2	6	8110	8115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385989541
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161	NC_017522	GTT	3	9	8235	8243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385989541
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163	NC_017522	CTG	2	6	8365	8370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989541
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169	NC_017522	GCC	4	12	8518	8529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989541
170	NC_017522	GTT	2	6	8535	8540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385989541
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172	NC_017522	GACA	2	8	8662	8669	50 %	0 %	25 %	25 %	385989542
173	NC_017522	GCC	2	6	8677	8682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989542
174	NC_017522	GAC	2	6	8684	8689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989542
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242	NC_017522	TTC	2	6	11908	11913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385989543
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248	NC_017522	TGA	2	6	12092	12097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385989543
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254	NC_017522	GCC	2	6	13335	13340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989544
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259	NC_017522	GGC	2	6	13466	13471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989544
260	NC_017522	CGG	2	6	13506	13511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989544
261	NC_017522	GAG	2	6	13568	13573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385989544
262	NC_017522	CTCA	2	8	13661	13668	25 %	25 %	0 %	50 %	385989544
263	NC_017522	ACG	2	6	14022	14027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989545
264	NC_017522	CGG	2	6	14095	14100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989545
265	NC_017522	CGA	2	6	14119	14124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989545
266	NC_017522	TCA	2	6	14208	14213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385989545
267	NC_017522	GGT	2	6	14344	14349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385989545
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270	NC_017522	GGC	2	6	14625	14630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989546
271	NC_017522	TCG	2	6	14645	14650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989546
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274	NC_017522	GC	3	6	14747	14752	0 %	0 %	50 %	50 %	385989546
275	NC_017522	CCCG	2	8	14805	14812	0 %	0 %	25 %	75 %	385989546
276	NC_017522	TGAT	2	8	15493	15500	25 %	50 %	25 %	0 %	385989547
277	NC_017522	GGCGT	2	10	15512	15521	0 %	20 %	60 %	20 %	385989547
278	NC_017522	TGCT	2	8	15540	15547	0 %	50 %	25 %	25 %	385989547
279	NC_017522	GCT	3	9	15554	15562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989547
280	NC_017522	GCC	2	6	15564	15569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989547
281	NC_017522	GGC	2	6	15585	15590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989547
282	NC_017522	CCG	2	6	15599	15604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989547
283	NC_017522	ACC	2	6	15687	15692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385989547
284	NC_017522	GGC	2	6	15734	15739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989547
285	NC_017522	GCG	2	6	15746	15751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989547
286	NC_017522	GGC	2	6	15773	15778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989547
287	NC_017522	GGGCC	2	10	15795	15804	0 %	0 %	60 %	40 %	385989547
288	NC_017522	TGG	2	6	15805	15810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385989547
289	NC_017522	CG	3	6	15853	15858	0 %	0 %	50 %	50 %	385989547
290	NC_017522	CAT	2	6	15962	15967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385989547
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292	NC_017522	GCCC	2	8	16027	16034	0 %	0 %	25 %	75 %	385989547
293	NC_017522	CGC	2	6	16043	16048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989547
294	NC_017522	CGC	3	9	16058	16066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989547
295	NC_017522	GCT	2	6	16074	16079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989547
296	NC_017522	GAA	2	6	16146	16151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385989547
297	NC_017522	ACT	2	6	16228	16233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385989547
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300	NC_017522	GCC	2	6	16392	16397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385989548
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302	NC_017522	GCA	2	6	16491	16496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385989548
303	NC_017522	CA	3	6	16495	16500	50 %	0 %	0 %	50 %	385989548
304	NC_017522	GCGTT	2	10	16540	16549	0 %	40 %	40 %	20 %	385989548
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380	NC_017522	GC	3	6	19932	19937	0 %	0 %	50 %	50 %	385989550
381	NC_017522	GGA	2	6	19971	19976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385989550
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384	NC_017522	CCA	2	6	20212	20217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385989551
385	NC_017522	CGG	2	6	20308	20313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385989551
386	NC_017522	CTG	2	6	20357	20362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989551
387	NC_017522	TTAGC	2	10	20395	20404	20 %	40 %	20 %	20 %	385989551
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389	NC_017522	GCT	2	6	20431	20436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385989551
390	NC_017522	GGT	2	6	20447	20452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385989551
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496	NC_017522	CAT	2	6	24973	24978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385989554
497	NC_017522	CAA	2	6	25045	25050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385989554
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499	NC_017522	ATCAC	2	10	25259	25268	40 %	20 %	0 %	40 %	385989555
500	NC_017522	GTG	2	6	25310	25315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385989555

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